智利和巴拿马自贸谈判开始于1998年，但因敏感问题无法达成一致而长期搁浅，直到2005年才重启谈判，并于2006年2月达成一致。2006年12月和2007年12月，巴拿马和智利国会分别批准了该协定。根据协定，大部分商品将在10到15年的期限内取消关税。